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Identificación de isoformas producto de empalme alternativo en el gen ama1 de Toxoplasma gondii

dc.contributor.advisorGutiérrez, Andrés Julián
dc.contributor.advisorFarid Arenas, Aylan
dc.contributor.authorHernández de los Ríos, Alejandro
dc.date.accessioned2020-11-20T16:18:59Z
dc.date.available2020-11-20T16:18:59Z
dc.date.issued2008-11-05
dc.identifier.urihttps://bdigital.uniquindio.edu.co/handle/001/5740
dc.description.abstractEl empalme alternativo de genes produce diferentes transcritos de ARNm a partir de un solo gen. Aunque no se ha valorado su importancia en los genes de Toxoplasma, su alta frecuencia en genes eucariotas sugiere que este es uno de los mecanismos más importantes en el aumento de la diversidad proteica. Como todas las proteínas de micronemas, AMA1 es secretada por los taquizoítos de Toxoplasma durante el proceso de invasión, siendo una de las piezas indispensables para dicho proceso.eng
dc.description.tableofcontentsINTRODUCCIÓN 10 2. OBJETIVOS 12 2.1 OBJETIVO GENERAL 12 2.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS 12 3. MARCO TEORICO 13 3.1 Toxoplasma gondii 13 3.1.1 Ciclo de vida de T. gondii 14 3.1.2 Organelas secretoras de T. gondii 15 3.1.3 Genómica de Toxoplasma gondii 16 3.2 Proteína AMA1 17 3.3 Empalme alternativo de genes 19 3.3.1 Bioinformática y empalme alternativo de genes 23 3.3.2 Evidencia Bioinformática para el empalme alternativo de genes 24 3.3.3 Empalme alternativo y proteínas relacionadas en Toxoplasma gondii 25 4. METODOLOGIA 27 4.1. Herramientas Bioinformáticas 27 4.2. Extracción y Selección de isoformas 28 4.3. Fase experimental 29 4.3.1. Cultivo de parásitos 29 4.3.2. Diseño de cebadores 29 4.3.3. Extracción de ARN del parasito y RT-PCR 31 4.3.4. PCR y Electroforesis 31 5. RESULTADOS 33 5.1. Proteína Tg-AMA1 33 5.1.1. Exones e Intrones del gen Tg-ama1 33 5.1.2. Sitios Donadores y Aceptores del gen Tg-ama1 34 5.1.3. Secuencias ESEs en los exones de Tg-ama1 36 5.1.4. Regiones transmembranales de la proteína Tg-AMA1 37 5.1.5. Señal peptídica y sitios de clivaje 39 5.2. Genes Ortólogos de Tg-AMA1 40 5.3. Identificación de Isoformas del gen Tg-ama1 42 6. DISCUSIÓN 53 6.1. Organización exón-intron del Tg-AMA1 53 6.2. Genes ortólogos de Tg-ama1 54 6.3. Empalme alternativo de Tg-AMA1 56spa
dc.format.mimetypeapplication/pdfspa
dc.language.isospaspa
dc.rightsDerechos reservados - Universidad del Quindíospa
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/spa
dc.titleIdentificación de isoformas producto de empalme alternativo en el gen ama1 de Toxoplasma gondiispa
dc.typeTrabajo de grado - Pregradospa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessspa
dc.rights.creativecommonsAtribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)spa
dc.subject.armarcEmpalme alternativo
dc.subject.armarcIsoformas
dc.subject.armarcToxoplasma gondii
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1fspa
dc.type.driverinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesisspa
dc.type.versioninfo:eu-repo/semantics/publishedVersionspa
dc.relation.referencesAjioka J., et al. 1998. Gene discovery by EST sequencing in Toxoplasma gondii reveals sequences restricted to the Apicomplexa. Genome Res 8, 18-28.spa
dc.relation.referencesBoguski M., et al. 1993. dbEST – database for “expressed sequence tags”. Nat Genet 4, 332-333spa
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dc.relation.referencesBoothroyd J., et al. 1997. Genetic and biochemical analysis of development in Toxoplasma gondii. Phil.Trans. R. Soc. Lond. B. 352, 1347^1354spa
dc.relation.referencesBrecht S., et al. 2001. The Toxoplasma micronemal protein Mic4 is an adhesin composed of six conserved apple domains. The Journal of Biology Chemistry. Vol 276, No. 6. Issue of February 9spa
dc.description.degreelevelPregradospa
dc.description.degreenameBiólogospa
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias Básicas y Tecnologíasspa
dc.publisher.placeArmenia, Quindíospa
dc.publisher.programCiencias Básicas y Tecnologías - Biologíaspa
dc.type.contentTextspa
dc.type.redcolhttps://purl.org/redcol/resource_type/TPspa
dc.identifier.barcode071662
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85spa
dc.rights.coarhttp://purl.org/coar/access_right/c_abf2spa


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